تختلف طريقة توزيع الدرجات في نظام البكالوريا المصرية عن الثانوية العامة، إذ تُخصص 100 درجة لكل مادة في البكالوريا، بينما تُحسب درجات اللغة العربية في الثانوية العامة من 80 درجة، وباقي المواد من 60 درجة لكل مادة.
وتعتمد شهادة البكالوريا المصرية على توزيع متساوٍ للدرجات بين المواد الدراسية، سواء في الصف الثاني الثانوي أو الصف الثالث الثانوي، بواقع 100 درجة للمادة الواحدة.
ويشمل ذلك اللغة العربية والتاريخ واللغة الإنجليزية، إلى جانب مواد التخصص، حيث يدرس الطالب مادة تخصص واحدة في الصف الثاني الثانوي، ومادتين في الصف الثالث الثانوي، وفقًا للنظام المعتمد.
وفي المقابل، تختلف درجات المواد في الثانوية العامة، إذ تبلغ الدرجة النهائية لمادة اللغة العربية 80 درجة، بينما تبلغ 60 درجة لكل مادة من المواد الأخرى، بإجمالي 320 درجة وفقًا لما ورد في تفاصيل النظام.
وفيما يتعلق برسوم امتحانات البكالوريا المصرية، يُعفى الطالب من سداد رسوم التقدم في المرة الأولى، بينما يحدد وزير التربية والتعليم والتعليم الفني قيمة الرسوم للمحاولات التالية، على ألا تتجاوز 200 جنيه عن كل مرة.
وتُمنح شهادة البكالوريا للطالب في نهاية المرحلة الدراسية، وتتضمن نتيجة كل مقرر أدى امتحانه، والدرجة التي حصل عليها، وعدد مرات التقدم للامتحان، وتاريخ كل محاولة، والدرجات المحققة خلالها.



